當(dāng)我們研究監(jiān)督的機(jī)器學(xué)習(xí)問題時(shí),如果我們對結(jié)果感到滿意,那么很容易看到隨機(jī)森林或梯度提升模型如何執(zhí)行并停止實(shí)驗(yàn)。如果您僅用一行代碼就可以比較許多不同的模型,該怎么辦?如果您可以將數(shù)據(jù)科學(xué)過程的每個(gè)步驟(從功能工程到模型部署)減少到僅幾行代碼,該怎么辦?
這正是PyCaret發(fā)揮作用的地方。PyCaret是一個(gè)高級(jí),低代碼的Python庫,它使僅需幾行代碼即可輕松比較,訓(xùn)練,評估,調(diào)整和部署機(jī)器學(xué)習(xí)模型。從本質(zhì)上講,PyCaret基本上只是許多Scikit-learn,Yellowbrick,SHAP,Optuna和Spacy等數(shù)據(jù)科學(xué)庫的大型包裝。是的,您可以將這些庫用于相同的任務(wù),但是如果您不想編寫大量代碼,PyCaret可以節(jié)省大量時(shí)間。
在本文中,我將演示如何使用PyCaret快速輕松地構(gòu)建機(jī)器學(xué)習(xí)項(xiàng)目并為部署準(zhǔn)備最終模型。
安裝PyCaret
PyCaret是一個(gè)具有很多依賴項(xiàng)的大型庫。我建議使用Conda為PyCaret創(chuàng)建一個(gè)虛擬環(huán)境,這樣安裝不會(huì)影響您現(xiàn)有的任何庫。要在Conda中創(chuàng)建和激活虛擬環(huán)境,請運(yùn)行以下命令:
- conda create --name pycaret_env python=3.6
- conda activate pycaret_env
要安裝僅具有所需依賴項(xiàng)的默認(rèn)較小版本的PyCaret,可以運(yùn)行以下命令。
- pip install pycaret
要安裝完整版本的PyCaret,您應(yīng)該運(yùn)行以下命令。
- pip install pycaret[full]
一旦安裝了PyCaret,請停用虛擬環(huán)境,然后使用以下命令將其添加到Jupyter。
- conda deactivate
- python -m ipykernel install --user --name pycaret_env --display-name "pycaret_env"
現(xiàn)在,在瀏覽器中啟動(dòng)Jupyter Notebook之后,您應(yīng)該能夠看到將環(huán)境更改為剛創(chuàng)建的選項(xiàng)的選項(xiàng)。
> Changing the Conda virtual environment in Jupyter.
導(dǎo)入庫
您可以在此GitHub存儲(chǔ)庫中找到本文的完整代碼。在下面的代碼中,我僅導(dǎo)入了Numpy和Pandas來處理此演示的數(shù)據(jù)。
- import numpy as np
- import pandas as pd
讀取數(shù)據(jù)
對于此示例,我使用了Kaggle上可用的“加利福尼亞住房價(jià)格”數(shù)據(jù)集。在下面的代碼中,我將此數(shù)據(jù)集讀入一個(gè)數(shù)據(jù)框,并顯示了該數(shù)據(jù)框的前十行。
- housing_data = pd.read_csv('./data/housing.csv')housing_data.head(10)
> First ten rows of the housing dataset.
上面的輸出使我們對數(shù)據(jù)的外觀有所了解。數(shù)據(jù)主要包含數(shù)字特征和一個(gè)分類特征,用于每個(gè)房屋與海洋的接近度。我們試圖預(yù)測的目標(biāo)列是“ median_house_value”列。整個(gè)數(shù)據(jù)集總共包含20,640個(gè)觀測值。
初始化實(shí)驗(yàn)
現(xiàn)在我們有了數(shù)據(jù),我們可以初始化一個(gè)PyCaret實(shí)驗(yàn),該實(shí)驗(yàn)將對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理并為將在此數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練的所有模型啟用日志記錄。
- from pycaret.regression import *
- reg_experiment = setup(housing_data,
- target = 'median_house_value',
- session_id=123,
- log_experiment=True,
- experiment_name='ca_housing')
如下面的GIF中所示,運(yùn)行上面的代碼會(huì)對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,然后生成帶有實(shí)驗(yàn)選項(xiàng)的數(shù)據(jù)框。
> Pycaret setup function output.
比較基準(zhǔn)模型
我們可以立即比較不同的基線模型,以找到具有使用compare_models函數(shù)的最佳K折交叉驗(yàn)證性能的模型,如下面的代碼所示。在下面的示例中,出于演示目的,我已將XGBoost排除在外。
- best_model = compare_models(exclude=['xgboost'], fold=5)
> Results of comparing different models.
該函數(shù)將生成一個(gè)數(shù)據(jù)框,其中包含每個(gè)模型的性能統(tǒng)計(jì)信息,并突出顯示性能最佳的模型的指標(biāo),在本例中為CatBoost回歸器。
建立模型
我們還可以使用PyCaret在單行代碼中訓(xùn)練模型。create_model函數(shù)僅需要一個(gè)與您要訓(xùn)練的模型類型相對應(yīng)的字符串。您可以在PyCaret文檔頁面上找到此功能的可接受字符串的完整列表以及相應(yīng)的回歸模型。
- catboost = create_model('catboost')
create_model函數(shù)使用訓(xùn)練后的CatBoost模型的交叉驗(yàn)證指標(biāo)來生成上面的數(shù)據(jù)框。
超參數(shù)調(diào)整
現(xiàn)在我們有了訓(xùn)練有素的模型,我們可以通過超參數(shù)調(diào)整進(jìn)一步優(yōu)化它。只需一行代碼,我們就可以調(diào)整該模型的超參數(shù),如下所示。
- tuned_catboost = tune_model(catboost, n_iter=50, optimize = 'MAE')
> Results of hyperparameter tuning with 10-fold cross-validation.
最重要的結(jié)果(在這種情況下為平均指標(biāo))以黃色突出顯示。
可視化模型的性能
我們可以使用PyCaret創(chuàng)建許多圖表,以可視化模型的性能。PyCaret使用另一個(gè)稱為Yellowbrick的高級(jí)庫來構(gòu)建這些可視化文件。
殘留圖
默認(rèn)情況下,plot_model函數(shù)將為回歸模型生成殘差圖,如下所示。
- plot_model(tuned_catboost)
> Residual plot for the tuned CatBoost model.
預(yù)測誤差
通過創(chuàng)建預(yù)測誤差圖,我們還可以將預(yù)測值相對于實(shí)際目標(biāo)值可視化。
- plot_model(tuned_catboost, plot = 'error')
> Prediction error plot for the tuned CatBoost regressor.
上面的圖特別有用,因?yàn)樗鼮槲覀兲峁┝薈atBoost模型的R²系數(shù)的直觀表示。在理想情況下(R²= 1),當(dāng)預(yù)測值與實(shí)際目標(biāo)值完全匹配時(shí),此圖將僅包含沿虛線的點(diǎn)。
功能重要性
我們還可以可視化模型的功能重要性,如下所示。
- plot_model(tuned_catboost, plot = 'feature')
> Feature importance plot for the CatBoost regressor.
從上面的圖可以看出,在預(yù)測房屋價(jià)格時(shí),位數(shù)中位數(shù)是最重要的特征。由于此特征對應(yīng)于房屋建造區(qū)域的中位數(shù)收入,因此此評估非常合理。在高收入地區(qū)建造的房屋可能比低收入地區(qū)的房屋貴。
使用所有圖評估模型
我們還可以創(chuàng)建多個(gè)圖,以使用validate_model函數(shù)評估模型。
- evaluate_model(tuned_catboost)
> The interface created using the evaluate_model function.
解釋模型
interpret_model函數(shù)是用于解釋模型預(yù)測的有用工具。此函數(shù)使用一個(gè)稱為SHAP的可解釋機(jī)器學(xué)習(xí)庫,我在下面的文章中介紹了該庫。
僅需一行代碼,我們就可以為模型創(chuàng)建一個(gè)SHAPE蜂群圖。
- interpret_model(tuned_catboost)
> SHAP plot produced by calling the interpret_model function.
根據(jù)上面的圖,我們可以看到中位數(shù)收入字段對預(yù)測房屋價(jià)值的影響最大。
自動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí)
PyCaret還具有運(yùn)行自動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí)(AutoML)的功能。我們可以指定我們要優(yōu)化的損失函數(shù)或度量,然后讓庫接管如下所示。
- automlautoml_model = automl(optimize = 'MAE')
在此示例中,AutoML模型也恰好是CatBoost回歸變量,我們可以通過打印出該模型進(jìn)行確認(rèn)。
- print(automl_model)
運(yùn)行上面的print語句將產(chǎn)生以下輸出:
- <catboost.core.CatBoostRegressor at 0x7f9f05f4aad0>
產(chǎn)生預(yù)測
預(yù)報(bào)模型功能允許我們通過使用來自實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)或新的看不見的數(shù)據(jù)來生成預(yù)測。
- pred_holdouts = predict_model(automl_model)
- pred_holdouts.head()
上面的predict_model函數(shù)為交叉驗(yàn)證期間用于驗(yàn)證模型的保持?jǐn)?shù)據(jù)集生成預(yù)測。該代碼還為我們提供了一個(gè)數(shù)據(jù)框,其中包含針對AutoML模型生成的預(yù)測的性能統(tǒng)計(jì)信息。
> Predictions generated by the AutoML model.
在上面的輸出中,“標(biāo)簽”列表示由AutoML模型生成的預(yù)測。我們還可以對整個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)測,如下面的代碼所示。
- new_data = housing_data.copy()
- new_data.drop(['median_house_value'], axis=1, inplace=True)
- predictions = predict_model(automl_model, data=new_data)
- predictions.head()
保存模型
PyCaret還允許我們使用save_model函數(shù)保存經(jīng)過訓(xùn)練的模型。此功能將模型的轉(zhuǎn)換管道保存到pickle文件中。
- save_model(automl_model, model_name='automl-model')
我們還可以使用load_model函數(shù)加載保存的AutoML模型。
- loaded_model = load_model('automl-model')
- print(loaded_model)
打印出加載的模型將產(chǎn)生以下輸出:
- Pipeline(memory=None,
- steps=[('dtypes',
- DataTypes_Auto_infer(categorical_features=[],
- display_types=True, features_todrop=[],
- id_columns=[], ml_usecase='regression',
- numerical_features=[],
- target='median_house_value',
- time_features=[])),
- ('imputer',
- Simple_Imputer(categorical_strategy='not_available',
- fill_value_categorical=None,
- fill_value_numerical=None,
- numer...
- ('cluster_all', 'passthrough'),
- ('dummy', Dummify(target='median_house_value')),
- ('fix_perfect', Remove_100(target='median_house_value')),
- ('clean_names', Clean_Colum_Names()),
- ('feature_select', 'passthrough'), ('fix_multi', 'passthrough'),
- ('dfs', 'passthrough'), ('pca', 'passthrough'),
- ['trained_model',
- <catboost.core.CatBoostRegressor object at 0x7fb750a0aad0>]],
- verbose=False)
從上面的輸出中可以看到,PyCaret不僅在流水線的末尾保存了經(jīng)過訓(xùn)練的模型,還在流水線的開始處保存了特征工程和數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟?,F(xiàn)在,我們在一個(gè)文件中有一個(gè)可用于生產(chǎn)的機(jī)器學(xué)習(xí)管道,我們不必?fù)?dān)心將管道的各個(gè)部分放在一起。
模型部署
現(xiàn)在我們已經(jīng)準(zhǔn)備好可以生產(chǎn)的模型管道,我們還可以使用deploy_model函數(shù)將模型部署到諸如AWS的云平臺(tái)。如果打算將模型部署到S3存儲(chǔ)桶,則在運(yùn)行此功能之前,必須運(yùn)行以下命令來配置AWS命令行界面:
- aws configure
運(yùn)行上面的代碼將觸發(fā)一系列提示,提示您需要提供諸如AWS Secret Access Key之類的信息。完成此過程后,就可以使用deploy_model函數(shù)部署模型了。
- deploy_model(automl_model, model_name = 'automl-model-aws',
- platform='aws',
- authentication = {'bucket' : 'pycaret-ca-housing-model'})
在上面的代碼中,我將AutoML模型部署到了AWS中名為pycaret-ca-housing-model的S3存儲(chǔ)桶中。從這里,您可以編寫一個(gè)AWS Lambda函數(shù),該函數(shù)從S3中提取模型并在云中運(yùn)行。PyCaret還允許您使用load_model函數(shù)從S3加載模型。
MLflow用戶界面
PyCaret的另一個(gè)不錯(cuò)的功能是,它可以使用稱為MLfLow的機(jī)器學(xué)習(xí)生命周期工具來記錄和跟蹤您的機(jī)器學(xué)習(xí)實(shí)驗(yàn)。運(yùn)行以下命令將從本地主機(jī)在瀏覽器中啟動(dòng)MLflow用戶界面。
- !mlflow ui
> MLFlow dashboard.
在上面的儀表板中,我們可以看到MLflow可以跟蹤您的PyCaret實(shí)驗(yàn)的不同模型的運(yùn)行情況。您可以查看性能指標(biāo)以及實(shí)驗(yàn)中每次運(yùn)行的運(yùn)行時(shí)間。
使用PyCaret的利與弊
如果您已經(jīng)閱讀了此書,則現(xiàn)在對如何使用PyCaret有了基本的了解。雖然PyCaret是一個(gè)很棒的工具,但它有其自身的優(yōu)缺點(diǎn),如果您打算將其用于數(shù)據(jù)科學(xué)項(xiàng)目,則應(yīng)注意這一點(diǎn)。
優(yōu)點(diǎn):
- 低代碼庫。
- 非常適合簡單的標(biāo)準(zhǔn)任務(wù)和通用機(jī)器學(xué)習(xí)。
- 為回歸,分類,自然語言處理,聚類,異常檢測和關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘提供支持。
- 使創(chuàng)建和保存模型的復(fù)雜轉(zhuǎn)換管道變得容易。
- 使可視化模型性能變得容易。
缺點(diǎn):
- 到目前為止,由于NLP實(shí)用程序僅限于主題建模算法,因此PyCaret對于文本分類而言并不理想。
- PyCaret不是深度學(xué)習(xí)的理想選擇,并且不使用Keras或PyTorch模型。
- 您無法執(zhí)行更復(fù)雜的機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù),例如使用PyCaret(至少在版本2.2.0中)進(jìn)行圖像分類和文本生成。
- 通過使用PyCaret,您將在某種程度上犧牲對簡單和高級(jí)代碼的控制。
概括
在本文中,我演示了如何使用PyCaret完成機(jī)器學(xué)習(xí)項(xiàng)目中的所有步驟,從數(shù)據(jù)預(yù)處理到模型部署。盡管PyCaret是有用的工具,但是如果您打算將其用于數(shù)據(jù)科學(xué)項(xiàng)目,則應(yīng)了解其優(yōu)缺點(diǎn)。PyCaret非常適合使用表格數(shù)據(jù)進(jìn)行通用機(jī)器學(xué)習(xí),但是從2.2.0版本開始,PyCaret不適用于更復(fù)雜的自然語言處理,深度學(xué)習(xí)和計(jì)算機(jī)視覺任務(wù)。但這仍然是一種節(jié)省時(shí)間的工具,誰知道,也許開發(fā)人員將來會(huì)增加對更復(fù)雜任務(wù)的支持?
如前所述,您可以在GitHub上找到本文的完整代碼。https://github.com/AmolMavuduru/PyCaretTutorial
原文鏈接:https://towardsdatascience.com/how-to-use-pycaret-the-library-for-lazy-data-scientists-91343f960bd2