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Mongodb數(shù)據(jù)庫轉(zhuǎn)換為表格文件的庫

前言

大家好，我是吳老板。今天給大家分享一個可將Mongodb數(shù)據(jù)庫里邊的文件轉(zhuǎn)換為表格文件的庫，這個庫是我自己開發(fā)的。

Mongo2file庫是一個 Mongodb 數(shù)據(jù)庫轉(zhuǎn)換為表格文件的庫。

在我的日常工作中經(jīng)常和 mongodb 打交道，而從 mongodb 數(shù)據(jù)庫中批量導(dǎo)出數(shù)據(jù)為其他格式則成為了剛需。

如果您跟我一樣每次導(dǎo)出數(shù)據(jù)時都需要重新編寫或到處尋找腳本代碼的話，這個庫可能會對您產(chǎn)生幫助。

依賴于快速 PyArrow

mongo2file 依賴于 PyArrow 庫。它是 C++ Arrow 的 Python 版本實現(xiàn)。

PyArrow 目前與 Python 3.7、3.8、3.9 和 3.10 兼容。

倉庫地址: https://github.com/apache/arrow。

如果您在 Windows 上遇到任何的導(dǎo)入問題或錯誤，您可能需要安裝 Visual Studio 2015。

警告: PyArrow 目前只支持到 win64 位 ( Python 64bit ) 操作系統(tǒng)。

其次，除了常見的 csv、excel、以及 json 文件格式之外, mongo2file 還支持導(dǎo)出 pickle、feather、parquet 的二進制壓縮文件。

pickle、feather、parquet 是 Python 序列化數(shù)據(jù)的一種文件格式, 它把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)成二進制進行存儲。從而大大減少讀取的時間。

安裝

pip install mongo2file

基本用法

快速開始

當(dāng) MongoEngine 控制類指定了 mongodb 表名稱時、將對數(shù)據(jù)表 (mongodb集合) 進行導(dǎo)出操作。

其類方法參數(shù)包括:

query: 指定對數(shù)據(jù)表的查詢參數(shù)、只對指定表名時有效。
folder_path: 指定導(dǎo)出目錄路徑。
filename: 指定導(dǎo)出文件名、默認(rèn)為表名稱 + 當(dāng)前時間。
_id: 指定是否導(dǎo)出 _id、布爾型、默認(rèn)為 False。
limit: 指定導(dǎo)出表的限制數(shù)據(jù)、int類型、默認(rèn)為 -1、即不限制。

import os from mongo2file import MongoEngine """ 作用于 MongoEngine 類未指定表名稱時 """ M = MongoEngine( host=os.getenv('MONGO_HOST', '127.0.0.1'), port=int(os.getenv('MONGO_PORT', 27017)), username=os.getenv('MONGO_USERNAME', None), password=os.getenv('MONGO_PASSWORD', None), database=os.getenv('MONGO_DATABASE', 'test_')
) def to_csv(): result_ = M.to_csv() assert "successfully" in result_ def to_excel(): result_ = M.to_excel() assert "successfully" in result_ def to_json(): result_ = M.to_json() assert "successfully" in result_ to_csv()

當(dāng) MongoEngine 控制類只指定了 mongodb 庫名稱時、將對數(shù)據(jù)庫下所有集合進行導(dǎo)出操作。

面對 mongo2file 的瓶頸和改進

對于 mongodb 的全表查詢、條件查詢、聚合操作、以及索引操作(當(dāng)數(shù)據(jù)達(dá)到一定量級時建議) 并不是直接影響數(shù)據(jù)導(dǎo)出的最大因素。

因為 mongodb 的查詢一般而言都非常快速，主要的瓶頸在于讀取數(shù)據(jù)庫之后將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為大列表存入表格文件時所耗費的時間。

這是一件非常可怕的事情。

當(dāng)沒有多線程(當(dāng)然這里的多線程并不是對同一文件進行并行操作，文件寫入往往是線程不安全的)、數(shù)據(jù)表查詢語句無優(yōu)化時，并且當(dāng)數(shù)據(jù)達(dá)到一定量級時(比如 100w 行)，單表單線程表現(xiàn)出來的效果真是讓人窒息。

在 mongo2file 在進行大數(shù)據(jù)量導(dǎo)出時表現(xiàn)的并沒有多么優(yōu)秀。導(dǎo)致的主要原因可能是:

采用的 xlsxwriter 庫寫入 excel 時是積極加載(非惰性)的，數(shù)據(jù)全部加載至內(nèi)存后插入表格。
大數(shù)據(jù)量插入表格時、跟宿主機器的性能有關(guān)。
mongo2file 表現(xiàn)的不如人意時，我做出了一下改進。
當(dāng)數(shù)據(jù)量過大時，數(shù)據(jù)表分塊讀取，導(dǎo)出多表格。
增加線程池的最大并發(fā)數(shù)、當(dāng)選取的 block_size 值合適時，將發(fā)揮最大性能。

對于數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換一些建議

對于 xlsxwriter、openpyxl、xlwings 以及 pandas 引用的任何引擎進行寫入操作時、都會對寫入數(shù)據(jù)進行非法字符的過濾。這一點從部分源碼中可以看得出來。
由于行數(shù)據(jù)表中可能存在 excel 無法識別的非法字符 (比如空列表 []) , 當(dāng)寫至此行時將拋出非法類型的錯誤。
而比較恰當(dāng)合理的做法就是在存儲 mongodb 文檔時不要存入類似于 []、{} 的這種對原始數(shù)據(jù)無意義的空對象。

Reference API

MongoEngine

MongoEngine( host='localhost', port=27017, username=None, password=None, database='測試庫', collection='測試表_200000' )

to_csv(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù) :param is_block: 是否分塊導(dǎo)出 :param block_size: 塊大小、is_block 為 True 時生效

to_excel(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù) :param is_block: 是否分塊導(dǎo)出 :param block_size: 塊大小、is_block 為 True 時生效 :param mode: 導(dǎo)出模式, 枚舉類型、sheet 或 xlsx, 當(dāng) is_block 為 True 時生效 :param ignore_error: 是否忽略錯誤、數(shù)據(jù)表中存在非序列化類型時使用、這將一定程度上影響程序的性能

to_json(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù) :param is_block: 是否分塊導(dǎo)出 :param block_size: 塊大小、is_block 為 True 時生效

to_pickle(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù)

to_feather(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù)

to_parquet(query, folder_path, filename, ...)

:param query: 數(shù)據(jù)庫查詢條件、字典類型、只作用于單表導(dǎo)出 :param folder_path: 指定導(dǎo)出的目錄 :param filename: 指定導(dǎo)出的文件名 :param _id: 是否導(dǎo)出 _id 默認(rèn)否 :param limit: 限制數(shù)據(jù)表查詢的條數(shù)

總結(jié)

以上就是今天要分享的全部內(nèi)容了，總的來說，Mongo2file庫是一個可以將 Mongodb 數(shù)據(jù)庫轉(zhuǎn)換為表格文件的庫，不僅支持導(dǎo)出csv、excel、以及 json 文件格式, 還支持導(dǎo)出 pickle、feather、parquet 的二進制壓縮文件。歡迎大家積極嘗試。

原文地址:https://mp.weixin.qq.com/s/3H2OWEX-CbRGMGVIChmDzg